Program Studi D3 Teknologi Laboratorium Medis (Prodi D3 TLM) merupakan salah satu program studi yang ada di Universitas Muhamadiyah Surabaya. Universitas Muhammadiyah Surabaya pada awalnya terdiri atas beberapa lembaga pendidikan tinggi. Lembaga-lembaga tinggi tersebut, yakni Fakultas Ilmu Agama Islam Jurusan Da’wah (FIAD) yang berdiri sejak 15 September 1964, fakultas Tarbiyah Surabaya berdiri tahun 1975, IKIP Muhammadiyah Surabaya berdiri tahun 1980, Fakultas Syari’ah Surabaya berdiri tahun 1982, dan Institut Teknologi Muhammadiyah Surabaya berdiri tahun 1983. Berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan RI No. 0141/0/1984, IKIP Muhammadiyah Surabaya, Institut Teknologi Muhammadiyah Surabaya dan Fakultas Ekonomi Universitas Muhammadiyah Gresik bergabung menjadi satu dengan nama Universitas Muhammadiyah Surabaya. Seluruh jurusan yang ada di ketiga lembaga pendidikan tersebut, mendapat status terdaftarberdasarkan SK Mendikbud RI No. 0141/0/1984. Universitas Muhammadiyah Surabaya lahir dengan memiliki tiga fakultas, yakni Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan (FKIP) sebagai pengganti IKIP Muhammadiyah Surabaya, Fakultas Teknik sebagai pengganti Institut Teknologi Muhammadiyah Surabaya, dan Fakultas Ekonomi sebagai jelmaan Fakultas Ekonomi Muhamadiyah Gresik. Pada tahun 1985 berdasarkan Surat keputusan Pimpinan Wilayah Muhammdiyah Jawa Timur Nomor: Kep/003-V/1985, Fakultas Da’wah (FIAD), Fakultas Tarbiyah dan Fakultas Syari’ah berinduk ke Universitas Muhammadiyah Surabaya, dan ketiga fakultas ini bergabung dalam satu wadah, yakni Fakultas Ilmu Agama Islam (FIAI). Untuk memenuhi kebutuhan tenaga kesehatan, khususnya Ahli Madya Kesehatan, maka pada tahun 1992 Pimpinan Pusat Muhammadiyah Majelis Pembina Kesehatan melalui surat No:IV.B/4.a/220/1992 tanggal 14 Desember 1992 mengajukan permohonan pendirian pendidikan ahli madya kesehatan di lingkungan Muhammadiyah / Aisyiyah kepada sekretaris Jenderal Departemen Kesehatan RI. Menjawab kebutuhan masyarakat akan pelayanan pemeriksaan laboratorium medis dan industri. Universitas Muhammadiyah Surabaya sebagai salah satu lembaga pendidikan tinggi yang bernafaskan islam terpanggil untuk menyediakan SDM Analis laboratorium yang handal, profesional, serta berakhlakul karimah, dengan menyelenggarakan Akademi Analis Kesehatan Universitas Muhammadiyah Surabaya yang berdiri pada tanggal 26 September 2001 dengan berdasarkan pada SK Mendikbud RI No.184/D/O/2001, dengan pembinaan PUSDIKNAKES dan telah mendapatkan status Akreditasi B berdasarkan SK Kepala PUSDIKNAKES No. HK.00.06.2.2.2042 tanggal 29 Desember 2005. Seiring dengan adanya perubahan kebijakan yang menyangkut kelembagaan Peguruan Tinggi Diploma Kesehatan, Akademi Analis Kesehatan Unmuh Surabaya senantiasa mngadopsi kebijakan DIKTI melalui kopertis wilayah VII terutama dalam hal informasi proses pembelajaran yang terprogram sebagai EPSBED. Pada tahun 2008 Akademi Analis Kesehatan diproses untuk bergabung di dalam Fakultas Ilmu Kesehatan (FIK) menjadi prodi D-3 Analis Kesehatan, dan proses merger ini masih terus berjalan hingga saat ini sudah memasuki tahap presentasi program studi dan Integrasi PDPT Akademi Analis kesehatan sebagai bagian dari sistem informasi PDPT Universitas Muhammadiyah Surabaya. Untuk itu, Akademi Analis Kesehatan UNMUH Surabaya senantiasa melakukan perpanjangan ijin penyelenggaran pendidikan melalui pelaporan EPSBED. Secara Berkala per semester Akademi Analis Kesehatan senantiasa melakukan pelaporan EPSBED mengenai proses pembelajaran yang dilakukan semester ganjil. Pada tahun 2017 dengan adanya nomenklatur penamaan program studi yang baru maka prodi D-3 Analis Kesehatan berubah nama menjadi Prodi D3 Teknologi Laboratorium Medis (D3 TLM). Dalam perkembangannya sampai dengan tahun 2009 program studi D-3 Analis Kesehatan Akademi Analis Kesehatan Unmuh Surabaya telah terakreditasi oleh Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT) Departemen Pendidikan Nasional, dengan status akreditasi C dengan SK No. 017/BAN-PT/AkIX/DPL-III/VIII/2009. Status Akreditasi ini berlaku hingga tahun 2014. Dan melakukan Akreditasi kembali pada tahun 2015, dengan status akreditasi B dengan SK No. 771/SK/BAN-PT/AKRED/DPL-III/VII/2015. Status Akreditasi ini berlaku hingga tahun 2020.